Секвенатор GS Junior компании Roche
- 11 Апрель 2013
Секвенатор GS Juniorпредназначен для решения задач геномики, транскриптомики, метагеномики и в клинической практике, где необходимы точные данные о последовательности ДНК или РНК возможно применение методов геномного секвенирования нового поколения (NGS).
Система GS Junior разработана на основе технологии пирофосфатного секвенирования 454 Life Sciences. Этот компактный геномный секвенатор является уникальной автоматической системой для параллельного анализа более ста тысяч фрагментов, при средней длине анализируемого фрагмента в 400 нуклеотидов.
Области применения:
- прямое, клональное секвенирование ампликонов (ПЦР-продуктов)
- таргетное ресеквенирование интересующих областей человеческого генома
- de novo секвенирование микробных и вирусных геномов
- исследование метагеномов сложных образцов из окружающей среды
- детекция патогенов
- сверхглубокое секвенирование ампликонов с целью поиска редких соматических мутаций
- обнаружение минорных вариаций ВИЧ, вирусных гепатитов, гаплотипирование,
- HLA-типирование
Технические характеристики
|
Производительность |
> 35 миллионов высококачественных, |
|
Время запуска |
10 часов – секвенирование |
|
Длина отдельных |
Модальная длина = 500 нуклеотидов |
|
Точность |
Длина прочтений Q20 = 400 нуклеотидов |
|
Количество прочтений |
100 000 прочтений (в среднем)* |
|
Образец |
Геномная ДНК, ампликоны, кДНК, BAC |
|
Размеры |
40 см (ширина) x 60 см (глубина) |
|
Компьютер |
Операционная система Linux в |
|
Операционная система |
Linux в компьютере HP входят в систему. |